Es kommt sehr auf den Lehrer an.

Grundsätzlich ist der Unterschied bei Goju-ryu zu Shotokan-ryu größer als zwischen einigen anderen Stilen.
Beide Stile haben fast keine gemeinsamen Kata im Curriculum.
Daraus leitet sich zumeist auch unterschiedliche Schwerpunkte in den Bewegungen/Techniken ab.
Ist ein Lehrer eher Wettkampforientiert schrumpfen diese Unterschiede wieder.

Ein großer Unterschied kann auch Vorteile haben - so gibt es weniger Verwechslungsgefahr.